Merlin föddes i Ealdor, en liten by som ligger i kungariket Cenred, Essetir. Hans mor är Hunith , och hans far var Balinor . Gaius hjälpte drakherren Balinor att fly från Uthers stora utrensning och gömde honom tillsammans med Hunith i Ealdor. De två blev förälskade, men Uther upptäckte snart Balinors gömställe och skickade riddare för att gripa honom. Balinor tvingades fly och lämnade Hunith bakom sig. Före eller efter Balinors avfärd upptäckte Hunith att hon var gravid, och Merlin föddes senare. Merlin skulle inte få träffa sin far förrän många år senare. Merlin föddes med magi , och enligt denna gjorde han magi innan han lärde sig tala. Enligt Den stora draken förutspåddes Merlins födelse av många kulturer. Druiderna kallar honom till exempel för "Emrys" (som betyder "odödlig"), ett namn som först användes av Mordred. Draken sade också att det var Merlins öde att skydda Arthur Pendragon och hjälpa honom att förena kungarikena i Albion och återföra magin till regionen. Under sin barndom i Ealdor blev Merlin vän med William, den ende som kände till hans magiska krafter. Vid ett tillfälle fällde Merlin ett träd med sin magi i avsikt att hugga ved och krossade nästan den gamle mannen Simmons , som hatade Merlin, i processen . Men enligt Will fick den grinige killen skylla sig själv. Merlin lämnade sin hemby Ealdor för att bo i kungariket Camelot, där han blev tjänare till prins Arthur, som han så småningom blev mycket nära vän med. Sedan dess, och med hänvisning till profetian från den stora draken, Kilgharrah, började Merlin sin plikt att skydda Arthur på hans väg till tronen. Merlin är förutbestämd att bli den största och mäktigaste trollkarl som någonsin levt, och använda sina krafter för att släppa loss magi och återuppliva den gamla religionen så att den kan samexistera med den nya religionen. Han är också förutbestämd att stå vid Arthurs sida som hans rådgivare och följeslagare, och därmed återförena alla kungariken i landet till Albion i en tid av fred och välstånd.