Ganondorf är en stor muskulös extremt kraftfull Gerudo trollkarl. Han är en skurk av ren ondska och en grym, hänsynslös krigsherre vars mål är att erövra kungariket Hyrule. Ganons enda ambition i livet är att få Trikraften och dominera världen med hjälp av de förmågor som genomsyras av dem.