Merlín nació en Ealdor , un pequeño pueblo situado en el reino de Cenred , Essetir . Su madre es Hunith y su padre Balinor. Gaius ayudó a Balinor, un señor dragón, a escapar de la Gran Purga de Uther, escondiéndolo con Hunith en Ealdor. Ambos se enamoraron, pero Uther pronto descubrió el escondite de Balinor y envió caballeros para arrestarlo. Balinor se vio obligado a huir, dejando atrás a Hunith. Antes o después de la partida de Balinor, Hunith descubrió que estaba embarazada, y más tarde nació Merlín. Merlín no volvería a ver a su padre hasta muchos años después. Merlín nació con magia y, según esto, hizo magia antes de aprender a hablar. Según el Gran Dragón , el nacimiento de Merlín fue profetizado por muchas culturas. Por ejemplo, los druidas se refieren a él como "Emrys" (que significa "inmortal"), un nombre utilizado por primera vez por Mordred . El Dragón también declaró que el destino de Merlín era proteger a Arturo Pendragon , y ayudarle a unir los reinos de Albión , y devolver la magia a la región. Durante su infancia en Ealdor, Merlín se hizo amigo de Guillermo , el único que conocía la existencia de sus poderes mágicos. En una ocasión, Merlín derribó un árbol con su magia con la intención de cortar leña, casi aplastando al viejo Simmons , que odiaba a Merlín, en el proceso . Pero según Will, el gruñón se lo tenía merecido. Merlín abandonó su pueblo natal, Ealdor , para vivir en el reino de Camelot , donde se convirtió en el sirviente del príncipe Arturo, de quien acabó haciéndose muy amigo. Desde entonces, y actuando en referencia a la profecía hecha por el Gran Dragón, Kilgharrah, Merlín comenzó su deber de proteger a Arturo en su camino hacia el trono. Merlín está destinado a convertirse en el mayor y más poderoso hechicero que jamás haya existido, y a utilizar sus poderes para desatar la magia y revivir la Antigua Religión para que coexista con la nueva. Él también está destinado a permanecer al lado de Arturo como su consejero y compañero, y así reunir a todos los reinos del país en Albión en una era de paz y prosperidad.