Мерлин родился в Эалдоре, небольшой деревушке, расположенной в королевстве Ценред, Эссетир. Его мать - Хунит, а отец - Балинор. Гаюс помог Балинору, повелителю драконов, спастись от Утера во время Великой Чистки и спрятал его вместе с Хунит в Эалдоре. Они полюбили друг друга, но вскоре Утер обнаружил убежище Балинора и послал рыцарей арестовать его. Балинор был вынужден бежать, оставив Хунит. До или после отъезда Балинора Хунит обнаружила, что беременна, и впоследствии на свет появился Мерлин. Мерлин увидит своего отца лишь много лет спустя. Мерлин родился с магией, и, согласно этому, он творил волшебство еще до того, как научился говорить. Согласно "Великому дракону", рождение Мерлина было предсказано во многих культурах. Например, друиды называют его "Эмрис" (что означает "бессмертный"), это имя впервые использовал Мордред. Дракон также заявил, что судьба Мерлина - защищать Артура Пендрагона, помогать ему объединять королевства Альбиона и возвращать магию в этот регион. Во время своего детства в Эалдоре Мерлин подружился с Уильямом, единственным, кто знал о существовании его магических способностей. Однажды Мерлин с помощью своей магии срубил дерево, намереваясь нарубить дров, и чуть не раздавил при этом старика Симмонса, который ненавидел Мерлина. Но, по словам Уилла, ворчун и так справился. Мерлин покинул свою родную деревню, Эалдор, чтобы поселиться в королевстве Камелот, где стал слугой принца Артура, с которым со временем очень подружился. С тех пор, следуя пророчеству Великого Дракона Килгара, Мерлин начал выполнять свой долг по защите Артура на пути к трону. Мерлину суждено стать самым великим и могущественным колдуном, который когда-либо жил, и использовать свои силы, чтобы высвободить магию и возродить старую религию, чтобы она могла сосуществовать с новой. Ему также суждено встать рядом с Артуром в качестве его советника и спутника, и таким образом воссоединить все королевства страны в Альбион в эпоху мира и процветания.