Lordi Liu Kang on valinnut sinut Mortal Kombat -turnauksen mestariksi, mutta pelissä on eräs käänne. Olet myös Supernaturalin voimakkaan arkkienkeli Mikaelin riivaama. Kamppailet kuitenkin hallitaksesi Mikaelia ja estääksesi häntä ottamasta valtaasi kokonaan. Kun turnaus lähestyy, harjoittelet kovasti omien kykyjesi valjastamiseksi ja yrität samalla pitää Mikaelin voiman kurissa. Se on jatkuvaa taistelua itsessäsi, kun selviydyt Mortal Kombatin haasteista ja sisäisestä kamppailusta arkkienkelin kanssa. Koko turnauksen ajan kohtaat pelottavia vastustajia ja sinun on luotettava omiin taitoihisi ja päättäväisyyteesi taistellaksesi. Toisinaan Mikaelin läsnäolo käy ylivoimaiseksi, ja pelkäät menettäväsi hallinnan kokonaan. Lordi Liu Kangin ja liittolaistesi tuella löydät kuitenkin voimia pitää Mikael loitolla. Viimeisen taistelun lähestyessä kohtaat voimakkaimman vastustajan tähän mennessä. Taistelu on uuvuttavaa, ja Mikaelin vaikutus kasvaa hetki hetkeltä. Kaivat kuitenkin syvälle itseesi ja käytät omaa sisäistä voimaasi ja päättäväisyyttäsi.