Ganondorf on suuri, lihaksikas ja erittäin voimakas gerudojen velho. Hän on paha ja julma, häikäilemätön sotapäällikkö, jonka tavoitteena on vallata Hyrulen kuningaskunta. Ganonin ainoa tavoite elämässä on saada Triforce ja hallita maailmaa sen antamien kykyjen avulla.