Мерлин е роден в Еалдор , малко селце, намиращо се в кралството Ценред , Есетер . Майка му е Хунит , а баща му е Балинор . Гай помогнал на Балинор, драконоукротител , да избяга от Великата чистка на Утер , като го скрил заедно с Хунит в Еалдор . Двамата се влюбват, но Утер скоро открива скривалището на Балинор и изпраща рицари да го арестуват. Балинор е принуден да избяга, оставяйки Хунит зад себе си. Преди или след заминаването на Балинор Хунит открива, че е бременна, и по-късно се ражда Мерлин. Мерлин вижда баща си едва след много години. Мерлин е роден с магия , а според това той е правил магии, преди да се научи да говори. Според Големия дракон , раждането на Мерлин било предсказано от много култури. Например друидите го наричат "Емрис" (което означава "безсмъртен") - име, използвано за първи път от Мордред . Драконът също така заявява, че съдбата на Мерлин е да защити Артур Пендрагон , да му помогне да обедини кралствата на Албион и да върне магията в региона. По време на детството си в Еалдор Мерлин се сприятелява с Уилям , единственият, който знае за съществуването на магическите му сили. При един случай Мерлин отсича дърво с магията си с намерение да нареже дърва, като при това почти смазва стареца Симънс , който мрази Мерлин. Но според Уил намръщеният човек си го бил получил. Мерлин напуска родното си село Еалдор , за да заживее в кралство Камелот , където става слуга на принц Артур, с когото в крайна сметка стават много близки приятели. Оттогава и действайки във връзка с пророчеството, направено от Великия дракон Килгара, Мерлин започва да изпълнява дълга си да защитава Артур по пътя му към трона. Мерлин е предопределен да се превърне в най-великия и най-могъщия магьосник, живял някога, и да използва силите си, за да отприщи магията и да възроди Старата религия, която да съжителства с новата. Той също е предопределен да застане до Артур като негов съветник и спътник и по този начин да обедини всички кралства на страната в Албион в епоха на мир и благоденствие.